Mittels eines Sputter-Apparates werden die getrockneten Präparate mit einer 10 bis 30 nm dicken Schicht eines Schwermetalls, z.B. Gold bedeckt, um die Oberfläche des Präparates für Elektronen leitfähig zu machen. Hierfür werden die Proben in eine mit Argongas gefüllte Vakuumkammer gebracht. Das Gas wird anschliessend durch eine Hochspannung ionisiert. Die beschleunigten Argon-Ionen lösen aus der Kathode atomares Gold, das sich auf der Probenoberfläche niederschlägt.