In der Zona intermedia liegen Nervenzellen des Nucleus thoracicus (Stilling-Clarke-Säule), welche unmittelbar an die Basis des Hinterhorns reichen. Im Seitenhorn findet man Nervenzellen des Nucleus intermediolateralis, die als Ursprungszellen für den Sympathicus dienen. Man beachte den durch eine Proliferation der Ependymzellen verschlossenen (obliterierten) Zentralkanal.