Im Transmissionselektronenmikroskop erscheinen die kondensierten Chromosomen als elektronendichten Aggregate.
Die Kernhülle ist in dieser Phase der Zellteilung grösstenteils in kurze Membranprofile aufgelöst, sodass Zellorganellen wie z.B. Mitochondrien oder rER Profile in direkten Kontakt zu den Chromosomen stehen.