Die Schleimhaut des Jejunums bildet 0,5 bis 1,5 mm hohe Zotten, welche in die Lichtung ragen und die Oberfläche um das Fünffache vergrössern. Zwischen den Zotten liegen die durchschnittlich 0,5 mm tiefen Krypten (Lieberkühn-Drüsen), welche bis dicht an die Lamina muscularis mucosae ragen.