Die Innensegmente der Fotorezeptoren bilden das metabolische Zentrum. Sie enthalten dementsprechen zahlreiche Mitochondrien. Die Innensegmente der Stäbchenzellen haben eine unregelmässige Oberfläche und sind kleiner als Innensegmente der Zapfenzellen.
Nach aussen gehen die Innensegmente über die schlanken Verbindungsstücke in die Aussensegmente mit komplexen Membrandifferenzierungen (Scheiben bzw. Einfaltungen) über, wobei an diesem Präparat Stäbchen und Zapfen nicht zu unterscheiden sind.