Der Thymus ist von einer schmalen Bindegewebskapsel umgeben, von der schmale Septen ausgehen. Dadurch entstehen unvollständige Läppchen, die nur in der zellreichen Thymusrinde voneinander getrennt sind. Das zellärmere und heller erscheinende Mark verbindet die Läppchen untereinander; es ist u. a. durch die bis zu mehreren Millimetern grossen Hassall-Körperchen gekennzeichnet.