Benachbarte Alveolen sind durch dünne Interalveolarsepten getrennt. Im lichtmikroskopischen Routinepräparat ist der komplexe Aufbau dieser Septen nicht zu erkennen. Man sieht lediglich langgestreckte Zellkerne, die entweder zu Pneumozyten I (Alveolarepithelzelle I), Endothelzellen, Fibroblasten oder kontraktilen Zellen gehören und kleinere Gruppen von Pneumozyten II (Alveolarepithelzelle II), die als kubische Zellen in den Nischen der Alveolarwände liegen. Alveolarmakrophagen liegen häufig frei in der Lichtung der Alveolen.